该规划称，为实施本规划12个领域的重点科技任务以及建设一批国家环境保护重点实验室、环境保护工程技术中心和野外观测研究站，预计需要国家在环境保护科技领域投入经费约220亿元（不包括地方配套、企业投入和国际合作资金）。其中，重点领域科研业务费210亿元，能力建设（重点实验室、工程技术中心和野外观测研究站建设）经费10亿元。

“十二五”期间，国家还将投入10亿元，用于培育战略性新兴产业中的环保产业。其中，包括依托“水专项”等国家重大专项的实施，建立产业化平台，提高设备国产化率，降低成本，形成市场竞争能力；以垃圾处理、脱硫脱硝、土壤修复、环境监测等为重点领域，研发一批重点技术和装备；研发和示范一批新型环保材料、药剂和环境友好型产品；以城镇污水和垃圾处理、烟气脱硫脱硝、危险废物处理处置为重点，探索和建立污染防治设施建设和运营市场化、社会化机制与模式，发展提供系统解决方案的综合环境服务业。

该规划还提出，到“十二五”末，要研发出一批具有核心竞争力的环境污染物控制与生态保护关键技术，提出重点领域和重点行业的绿色经济、循环经济发展模式与关键技术，同时引导和培育5家以上环保产学研联盟，创新流域、区域污染治理机制，促进产学研用有机结合。